文件名称：pptc_cd276
文件大小：427KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-03 20:30:58
R
PPTC CD276 使用./scripts/main_pptc_cd276.R脚本准备图1、2和3A。 注意：由于Treehouse和GTEx数据集的大小，。/ data目录中仅提供了CD276的TPM。 要准备表达矩阵： Treehouse + GTEx：遵循treeGTEx_RNAseq.R和treeGTEx_qsub.R（qsub需要> 64GB RAM） PPTC PDX：遵循pptc_RNAseq.R
【文件预览】：
pptc_cd276-main
----figures()
--------pptc_cd276_SFig1.pdf(8KB)
--------pptc_cd276_SFig9.pdf(7KB)
--------pptc_cd276_Figure2.pdf(29KB)
--------pptc_cd276_Figure1.pdf(41KB)
--------pptc_cd276_Figure3.pdf(13KB)
----.DS_Store(6KB)
----scripts()
--------main_pptc_cd276.R(21KB)
--------treeGTEx_RNAseq_qsub.R(8KB)
--------treeGTEx_RNAseq.R(6KB)
--------pptc_RNAseq.R(5KB)
--------runKallisto.sh(476B)
----README.md(368B)
----data()
--------Objective-Responses.txt(917B)
--------PPTC-SMT-RTV.txt(2KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------RNA_data()
--------IHC_data()
--------PPTC-Ngreater1-RTV.txt(6KB)
--------Models-in-Study.txt(505B)
--------Histology-Colors.txt(881B)
----pptc_cd276.Rproj(205B)
----.gitignore(40B)