Central Proteomics Facilities Pipeline:用于鸟枪质谱蛋白质组学的数据分析管道。-开源

时间:2024-06-18 01:28:08
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文件名称:Central Proteomics Facilities Pipeline:用于鸟枪质谱蛋白质组学的数据分析管道。-开源

文件大小:154B

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更新时间:2024-06-18 01:28:08

开源软件

CPFP 为分析 MS/MS 蛋白质组学数据提供了一条管道,针对*蛋白质组学设施的需求。 == 项目状态 - 2019 年 1 月 3 日更新 == 自 2014 年我离开 UTSW 的蛋白质组学小组以来,CPFP 一直没有得到积极开发。 要访问用于分析蛋白质组学数据的最新算法,现在首选其他工具。 但是: * 牛津大学的 Phil Charles 对主 master 分支进行了有限的修复。 * 截至 2019 年,我自己(现在在 UTSW 的 BioHPC 高性能计算组)进行了有限的维护,以允许 CPFP 在 RHEL 7 / CentOS 7 上安装和运行,并更新了 TPP 5.1.0 和搜索工具。 这个更新的代码可以在 git 存储库的 utsw-biohpc 分支中找到,如果时间和测试允许,它可能会成为 2.2.0 版本。 ——大卫·特鲁吉安——2019/01/03


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