【文件属性】:
文件名称:pipetaxon:PipeTaxon将ncbi分类数据库公开为REST API
文件大小:24KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-01 02:14:54
python api django bioinformatics biology
Pipetaxon
PipeTaxon将ncbi分类数据库公开为REST API。 它打算由生物信息管道或dataviz应用程序使用。
主要特点
以API公开整个分类法数据库
提供用于人机交互的Web界面
(可选)可以从登录ID查询分类法
从分类ID中检索整个谱系
LCA端点(从分类ID的列表中检索最低的共同祖先)
允许排行
现场演示
入门(超级简单的方法)
在终端中复制并粘贴以下命令:
curl https://raw.githubusercontent.com/voorloopnul/pipetaxon/master/install/install.sh | sudo bash
pipetaxon install
pipetaxon start
转到浏览器并输入:
入门(简单方法)
Pipetaxon还是一个docker容器,您只需运行以下命令就可以轻松启动它:
dock
【文件预览】:
pipetaxon-master
----Dockerfile(238B)
----install()
--------pipetaxon.sh(1KB)
--------install.sh(230B)
--------build.sh(391B)
----pipetaxon()
--------wsgi.py(395B)
--------__init__.py(0B)
--------settings.py(3KB)
--------urls.py(277B)
----LICENSE(1KB)
----taxonomy()
--------serializers.py(813B)
--------models.py(3KB)
--------apps.py(91B)
--------templates()
--------management()
--------__init__.py(0B)
--------migrations()
--------views.py(1KB)
--------templatetags()
--------api.py(3KB)
--------tests.py(60B)
--------urls.py(573B)
----requirements.txt(80B)
----examples()
--------examples.py(1KB)
----manage.py(541B)
----.gitignore(1KB)
----.dockerignore(22B)
----README.md(5KB)