文件名称:fmriqa:功能磁共振成像数据的qa脚本
文件大小:10KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 15:04:10
Python
fmriqa 功能磁共振成像数据的qa脚本 创建功能磁共振成像数据集的质量摘要报告 估计FD / DVARS(Power等,2012) 执行Greve等人/ fBIRN尖峰检测 依存关系: 统计模型 麻木 尼巴贝 matplotlib scikit学习 报告实验室 用法:fmriqa.py bold_mcf.nii.gz(或任何适当命名的文件) 该主程序会获取经过运动校正的图像并执行质量检查-报告将保存到名为质量检查的子目录中 假定以下内容也存在于同一目录中(如果将infile称为bold_mcf.nii.gz):-bold_mcf_brain_mask.nii.gz:BET掩码-bold_mcf.par:mcflirt生成的运动参数
【文件预览】:
fmriqa-master
----mk_report.py(2KB)
----plot_timeseries.py(1KB)
----fmriqa.py(11KB)
----scrub.py(413B)
----get_fd.py(1KB)
----compute_fd.py(920B)
----README.md(656B)
----Makefile(300B)
----MAD.py(868B)
----mk_slice_mosaic.py(4KB)