mapula:在您选择的聚合级别生成映射统计信息

时间:2024-04-10 11:44:58
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文件名称:mapula:在您选择的聚合级别生成映射统计信息

文件大小:58KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-10 11:44:58

Python

马普拉 该软件包提供了一个命令行工具,该工具能够解析SAM格式的对齐方式并产生一系列有用的统计信息。 Mapula提供了几个子命令,每个命令都使用--help可以找到详细的用法说明。 安装 可以按照通常的Python传统安装Count mapula: pip install mapula 或通过conda: conda install mapula 用法 $ mapula -h usage: mapping-stats []" Available subcommands are: count Count mapping stats from a SAM/BAM file merge Combine mapula count's json outputs Collects stats from SAM/BAM


【文件预览】:
mapula-master
----.gitignore(1KB)
----README.md(4KB)
----CHANGELOG.md(823B)
----.gitlab-ci.yml(2KB)
----mapula()
--------merge.py(4KB)
--------observation.py(11KB)
--------count.py(14KB)
--------utils.py(905B)
--------main.py(1KB)
--------__init__.py(23B)
--------bio.py(3KB)
--------const.py(528B)
----requirements.txt(32B)
----LICENSE.md(15KB)
----images()
--------ONT_logo_590x106.png(35KB)
----MANIFEST.in(61B)
----setup.py(2KB)
----Makefile(1KB)

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