【文件属性】：
文件名称：ukbAgingPipeline:英国生物库处理管道
文件大小：3.05MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-17 22:57:40
Python
英国生物库处理管道
该存储库处理UK Biobank数据，以整合到Simons Brain Aging网站中。
此回购协议的作用：
将编码的UKB数据转换为可用格式。
下载并编译“批量” UKB数据。
执行修改后的PHESANT现象扫描量化AGE效应。
编译UK Biobank变量元数据。
将所有数据转储到SQL数据库中。
设置您的配置文件
[
{
" repo_dir " : " /gpfs/milgram/project/holmes/kma52/ukbAgingPipeline " ,
" base_dir " : " /gpfs/milgram/project/holmes/kma52/buckner_aging " ,
" ukb_enc " : " /gpfs/milgram/project/holmes/kma52/buckner_agi
【文件预览】：
ukbAgingPipeline-main
----bulk_download_config.json(329B)
----ref_files()
--------edge_list_d100.txt(31KB)
--------rfMRI_GoodComponents_d100_v1.txt(163B)
--------data-coding-ordinal-info.txt(6KB)
--------showcase.csv(3.22MB)
--------outcome-info.tsv(1.14MB)
--------edge_list_d25.txt(4KB)
--------codings.csv(3.92MB)
--------rfMRI_GoodComponents_d25_v1.txt(61B)
----Dockerfile(3KB)
----LICENSE(1KB)
----requirements.txt(0B)
----README.md(8KB)
----scripts()
--------02_create_ukb_sqlite.R(8KB)
--------utilities()
--------00c_download_genetic.py(3KB)
--------00_convert_ukbenc_data.py(2KB)
--------fake_data()
--------00b_download_bulk.py(7KB)
--------01_create_ukb_metadata.R(6KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------01_compile_bulk_data.py(3KB)
--------wrappers()
----config.json(688B)
----external()
--------ukb_tools()
--------ukb()