文件名称：ukbAgingPipeline:英国生物库处理管道
文件大小：3.05MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-07 16:44:20
Python
英国生物库处理管道 该存储库处理UK Biobank数据，以整合到Simons Brain Aging网站中。 此回购协议的作用： 将编码的UKB数据转换为可用格式。 下载并编译“批量” UKB数据。 执行修改后的PHESANT现象扫描量化AGE效应。 编译UK Biobank变量元数据。 将所有数据转储到SQL数据库中。 设置您的配置文件 [ { " repo_dir " : " /gpfs/milgram/project/holmes/kma52/ukbAgingPipeline " , " base_dir " : " /gpfs/milgram/project/holmes/kma52/buckner_aging " , " ukb_enc " : " /gpfs/milgram/project/holmes/kma52/buckner_agi
【文件预览】：
ukbAgingPipeline-main
----bulk_download_config.json(329B)
----ref_files()
--------edge_list_d100.txt(31KB)
--------rfMRI_GoodComponents_d100_v1.txt(163B)
--------data-coding-ordinal-info.txt(6KB)
--------showcase.csv(3.22MB)
--------outcome-info.tsv(1.14MB)
--------edge_list_d25.txt(4KB)
--------codings.csv(3.92MB)
--------rfMRI_GoodComponents_d25_v1.txt(61B)
----Dockerfile(3KB)
----LICENSE(1KB)
----requirements.txt(0B)
----README.md(8KB)
----scripts()
--------02_create_ukb_sqlite.R(8KB)
--------utilities()
--------00c_download_genetic.py(3KB)
--------00_convert_ukbenc_data.py(2KB)
--------fake_data()
--------00b_download_bulk.py(7KB)
--------01_create_ukb_metadata.R(6KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------01_compile_bulk_data.py(3KB)
--------wrappers()
----config.json(688B)
----external()
--------ukb_tools()
--------ukb()