文件名称：My_scripts：用于分析的简单脚本
文件大小：93KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-29 15:36:38
Python
我的脚本 简单的脚本进行分析
【文件预览】：
My_scripts-master
----bam_renameChr.py(1KB)
----bam2fq_by_readname.py(1007B)
----fasta_stats.py(4KB)
----qwrap.py(2KB)
----recircularize_gff.py(2KB)
----fastq_stats.jl(2KB)
----orf_finder.py(8KB)
----old()
--------Im_Uaena.sh(5KB)
--------Im_Uaena.py(8KB)
--------make_hic_contacts.py(2KB)
--------vcf_maf.samtools.py(1KB)
--------msa_benchmark.py(6KB)
--------Juicer_post_review.py(4KB)
--------io_benchmark.ipynb(31KB)
--------falcon_separate_phased.py(1KB)
--------vcf_to_fa_v1.py(5KB)
--------vcf_maf.varscan.py(1KB)
--------getContigInfo.pl(3KB)
--------batch_augutus.py(2KB)
--------practice_multiprocessing.ipynb(5KB)
--------extract_intron_from_aligned_fasta.py(3KB)
--------Juicer_assembly_to_agp.py(3KB)
--------racon_stitch_telomere.py(4KB)
--------guppy_demultiplexing.py(2KB)
----iterative_pilon.py(4KB)
----fastn_length_filter.py(8KB)
----trf_telomere_finder.py(7KB)
----fasta_wrap_line.py(2KB)
----fasta_findN.py(2KB)
----run_purge_haplotigs.sh(591B)
----vcf_getMAF.py(3KB)
----bam_stats.py(5KB)
----uc_split_fasta_by_cluster.py(1KB)
----fasta_rename.py(2KB)
----fastq_check_dups.py(2KB)
----deepsignal_CpG_calls_to_bed.py(2KB)
----gff_to_genoplotr_tab.py(5KB)
----run_guppy_barcoder.sh(735B)
----fasta_GCcontent_bed.py(949B)
----vcf_to_fa.py(5KB)
----fasta_id_filter.py(4KB)
----fasta_make_windows.py(2KB)
----remove_log.sh(227B)
----recircularize_fasta.py(1KB)
----assembly_rmdup.py(4KB)
----vcf_estimate_QV.py(2KB)
----easy_statistics.py(1KB)
----plink_dist_to_phylip.py(781B)
----fastq_interleave.py(833B)
----cds_codon_usage.py(2KB)
----fasta_pairwise_identity.py(11KB)
----collapse_bed.py(879B)
----iterative_racon.py(4KB)
----run_multi_fast5.sh(162B)
----uc_info.py(1KB)
----gff2fa.py(6KB)
----waitpid.sh(106B)
----fastq_stats.py(6KB)
----fastq_dedup.py(652B)
----dna2sixframe.py(700B)
----slack_notify.py(2KB)
----whatshap_stats.py(3KB)
----run_genomescope.sh(682B)
----rip_finder.py(9KB)
----agp2fasta.py(2KB)
----fasta_concatenate.py(2KB)
----run_guppy.sh(598B)
----fast5_check.py(4KB)
----ssh_twnia.sh(199B)
----.gitignore(39B)
----ncbi_fetch_seq.py(3KB)
----plot_coverage.R(3KB)
----fasta_remove_clone.py(2KB)
----alnfa_remove_invariant.py(2KB)
----lib()
--------readfq.py(2KB)
--------tqdm_hack.py(684B)
----fastq_check_qual.py(2KB)
----README.md(41B)
----run_purge_dups.sh(607B)
----mummer_wrapper.sh(639B)
----run_guppy_barcode_summary.py(1KB)
----fasta_sort.py(1KB)
----run_Haplomerger2.sh(1KB)
----alnfa_cut.py(812B)
----fastq_check_platform.py(7KB)