【文件属性】：
文件名称：ecDNA-Analytics:Web平台将metaDetect和ecSeg工具与各自的可视化集成在一起，用于染色体外DNA分析
文件大小：867KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-30 10:46:57
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ecDNA分析
该Web平台将metaDetect和ecSeg工具与各自的可视化集成在一起，用于染色体外DNA分析。 查看
工具
元检测
（ 是一个用于从整个幻灯片图像中识别细胞群中中期扩散的平台（实验性）
ecSeg
（ 是一个平台，旨在从用DAPI和FISH探针染色的中期图像中识别染色体外DNA（ecDNA）（Rajkumar，U.iScience 2019）
在线使用
在以下查看网络工具： //genomequery.ucsd.edu：
使用ecSeg
导航到ecSeg的“输入”页面，如下所示：
面板1-此输入面板适用于希望在可视化之前在tif图像上实际运行ecSeg的用户。 要开始，请单击开始。 将会弹出一个面板，并具有不同的输入部分。 要正确运行ecSeg，请选择一个包含输入图像的文件夹（DAPI / FISH中期扩散，仅TIF）。 ecSeg需要时间才能运行，因此请尝
【文件预览】：
ecDNA-Analytics-master
----config.py(807B)
----run.py(62B)
----requirements.txt(3KB)
----environment.yml(2KB)
----README.md(6KB)
----.gitignore(113B)
----app()
--------routes.py(13KB)
--------__init__.py(226B)
--------tools.py(2KB)
--------templates()
--------imagemanipulation.py(4KB)
--------static()