文件名称：ecDNA-Analytics:Web平台将metaDetect和ecSeg工具与各自的可视化集成在一起，用于染色体外DNA分析
文件大小：867KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-20 04:33:37
HTML
ecDNA分析 该Web平台将metaDetect和ecSeg工具与各自的可视化集成在一起，用于染色体外DNA分析。 查看 工具 元检测 （ 是一个用于从整个幻灯片图像中识别细胞群中中期扩散的平台（实验性） ecSeg （ 是一个平台，旨在从用DAPI和FISH探针染色的中期图像中识别染色体外DNA（ecDNA）（Rajkumar，U.iScience 2019） 在线使用 在以下查看网络工具： //genomequery.ucsd.edu： 使用ecSeg 导航到ecSeg的“输入”页面，如下所示： 面板1-此输入面板适用于希望在可视化之前在tif图像上实际运行ecSeg的用户。 要开始，请单击开始。 将会弹出一个面板，并具有不同的输入部分。 要正确运行ecSeg，请选择一个包含输入图像的文件夹（DAPI / FISH中期扩散，仅TIF）。 ecSeg需要时间才能运行，因此请尝
【文件预览】：
ecDNA-Analytics-master
----config.py(807B)
----run.py(62B)
----requirements.txt(3KB)
----environment.yml(2KB)
----README.md(6KB)
----.gitignore(113B)
----app()
--------routes.py(13KB)
--------__init__.py(226B)
--------tools.py(2KB)
--------templates()
--------imagemanipulation.py(4KB)
--------static()