【文件属性】：
文件名称：ecDNA:CSE 280A项目-癌症中的染色体外DNA（ecDNA）
文件大小：1.06MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-03-19 07:49:18
JupyterNotebook
ecDNA在癌症中
CSE 280A项目-癌症中的染色体外DNA（ecDNA）
策略1 （ data/oncoprint1.tsv ）：
ecDNA + =圆形，ecDNA- =否则
335个ecDNA +样本，1565个ecDNA-样本
最初的列是ecDNA +样品
最后一位ecDNA +患者是TCGA-G2-A2EK （Excel中为Col LY）
策略2 （ data/oncoprint2.tsv ）：
ecDNA + =圆形，ecDNA- =未检测到SCNA
335个ecDNA +样本，1041个ecDNA-样本
最初的列是ecDNA +样品
最后一位ecDNA +患者是TCGA-G2-A2EK （Excel中为Col LY）
【文件预览】：
ecDNA-main
----CSE280A-Projects.pdf(299KB)
----images()
--------GOF_circular_vs_others.png(16KB)
--------LOF_circular_vs_others.png(12KB)
--------distribution_of_samples.png(34KB)
--------LOF_circular_vs_noscna.png(12KB)
--------GOF_circular_vs_noscna.png(32KB)
----data()
--------oncoprint2.tsv(371KB)
--------T3_74K.pdf(75KB)
--------oncoprint3.tsv(135KB)
--------pcaa-master-platinum_set_2020.tsv(1.77MB)
--------sel_genes.txt(345B)
--------oncoprint1.tsv(512KB)
--------PATIENT_DATA_oncoprint.tsv(4.72MB)
----src()
--------analysis.ipynb(695KB)
--------analysis.py(19KB)
--------additional.ipynb(52KB)
----.gitignore(46B)
----README.md(534B)