文件名称:ross-在fastq文件上运行基本分析的一组脚本-Rust开发
文件大小:137KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-16 14:33:12
Rust Science
固定使用Unix流对fastq文件执行随机操作。 用Fasten保护您的分析! 在Rust Fasten中对Installation Fasten进行编程,使用Unix流对fastq文件执行随机操作。 用Fasten保护您的分析! 使用Fast编程语言对Installation Fasten进行编程。 有关Rust的更多信息,包括安装和可执行文件,可以在rust-lang.org上找到。 下载后,按如下方式使用Rust可执行文件:cd faste cargo build --release所有可执行文件都将在目录fasten / target / release中。 一般用法所有脚本都接受参数,读取unc
【文件预览】:
fasten-master
----.gitignore(307B)
----images()
--------monica.jpg(3KB)
--------marcel.png(11KB)
--------ursula.png(6KB)
--------carol.jpg(999B)
--------joey.png(10KB)
--------rachel.jpg(1KB)
--------chander.png(8KB)
--------emma.png(6KB)
--------phoebe.png(6KB)
--------barry.png(12KB)
--------UNG.png(8KB)
--------gunther.png(9KB)
--------ross.png(8KB)
----src()
--------bin()
--------io()
--------lib.rs(2KB)
----.travis.yml(525B)
----LICENSE(1KB)
----Cargo.toml(2KB)
----testdata()
--------R1.fastq(852B)
--------four_reads.fastq(844B)
--------R2.fastq(852B)
--------miseq.pe.fastq(220B)
--------four_reads.pe.fastq(2KB)
--------four_reads.gt_16_lines.fastq(860B)
----scripts()
--------readMetrics.sh(683B)
----README.md(3KB)
----tests()
--------fasten_sample.sh(1KB)
--------fasten_clean.sh(599B)
--------fasten_metrics.sh(510B)
--------fasten_quality_filter.sh(499B)
--------fasten_combine.sh(1KB)
--------fasten_kmer.sh(252B)
--------fasten_regex.sh(1KB)
--------fasten_replace.sh(1KB)
--------fasten_pe.sh(567B)
--------fasten_randomize.sh(1KB)
--------fasten_straighten.sh(309B)
--------fasten_validate.sh(406B)
--------fasten_trim.sh(813B)
--------fasten_shuffle.sh(835B)
----docs()
--------scripts.md(349B)
--------one-liners.md(5KB)
--------file-formats.md(739B)