文件名称：scprep:一组脚本和工具，用于加载，处理和处理单个单元格数据
文件大小：7.84MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-24 12:41:22
Python
scprep提供了一个用于在Python中加载，预处理和绘制矩阵的多合一框架，重点是单细胞基因组学。 scprep的理念： 数据不应隐藏在复杂的定制类对象中。 scprep可用于numpy数组，pandas数据帧和scipy稀疏矩阵，所有这些都是Python中流行的数据格式，并且已被接受为大多数常见算法的输入。 您的分析管道不必根据数据格式进行更改。 从numpy数组更改为pandas数据框会引入无尽的技术差异（例如，在索引矩阵中）。 scprep提供了与数据无关的方法，这些方法在所有格式上的工作方式都相同。 简单的分析应该意味着简单的代码。 scprep处理烦人的边缘情况，并设置了不错的默认值，因此您不必这样做。 使用框架不应受到限制。 因为没有任何东西对您隐藏，所以您可以像直接使用它们一样使用numpy，scipy，pandas和matplotlib的功能。 安装 可以在pi