HistomicsUI：用于病理图像注释和分析的Girder插件

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文件名称：HistomicsUI：用于病理图像注释和分析的Girder插件
文件大小：168KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-19 06:07:29
python histology digital-slide-archive bioimage-infomatics JavaScript 组织学UI 组织，可视化和分析组织学图像。 使用组织和管理整个幻灯片图像（WSI）文件。 它具有专用的界面，用于选择WSI，手动添加注释以及对全部或部分图像运行分析和算法。 Girder提供身份验证，访问控制和多种存储选项，包括使用本地文件系统和Amazon S2。 WSI图像通过模块读取和显示。 算法使用进行容器化，并使用 Girder插件运行。 它们可以通过和在多台工作计算机上运行。 提供了一组常用算法。 安装 Linux 在具有Python 3.6或更高版本Linux中： 先决条件： MongoDB必须已安装并正在运行。 必须安装适当版本的Python。 pip install histomicsui --find-links https://girder.github.io/large_image_wheels girder build girder serve