文件名称：gapmap:R包用于树状图和热图
文件大小：939KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-08 06:55:31
R
差距图 使用ggplot2绘制缺口簇热图的函数 这是源于gapmap版本0.0.3的分叉存储库，该版本已于2020年从CRAN中删除。作者Ryo Sakai的原始源代码可以在Bitbucket上。 我只是解决了该错误，然后将其重新提交到版本0.1.0的CRAN。
【文件预览】：
gapmap-main
----Meta()
--------vignette.rds(265B)
----.gitignore(70B)
----NAMESPACE(1KB)
----vignettes()
--------simple_example.Rmd(5KB)
--------tcga_example.Rmd(4KB)
----R()
--------set_most_right_leaf.R(623B)
--------is.gapdata.R(329B)
--------count_gap.R(1KB)
--------gap_heatmap.R(4KB)
--------as.gapdata.R(660B)
--------gap_dendrogram.R(5KB)
--------map.exp.R(805B)
--------format_number.R(348B)
--------sum_distance.R(1KB)
--------map.R(653B)
--------assign_branch_positions.R(2KB)
--------assign_positions.R(2KB)
--------calculate_gap.R(4KB)
--------gap_label.R(3KB)
--------get_segment_df.R(457B)
--------gap_data.R(3KB)
--------get_most_left_leaf.R(392B)
--------gapmap-package.R(2KB)
--------get_most_right_leaf.R(404B)
--------extract_list.R(2KB)
--------gapmap.R(7KB)
----data()
--------sample_tcga.rda(33KB)
----.Rbuildignore(137B)
----.travis.yml(435B)
----doc()
--------tcga_example.html(962KB)
--------simple_example.html(213KB)
--------simple_example.Rmd(5KB)
--------tcga_example.Rmd(4KB)
--------simple_example.R(3KB)
--------tcga_example.R(3KB)
----man()
--------sample_tcga.Rd(991B)
--------assign_branch_positions.Rd(559B)
--------gap_dendrogram.Rd(822B)
--------calculate_gap.Rd(1KB)
--------extract_list.Rd(669B)
--------format_number.Rd(371B)
--------gapmap.Rd(3KB)
--------gap_label.Rd(607B)
--------sum_distance.Rd(819B)
--------get_segment_df.Rd(494B)
--------map.exp.Rd(671B)
--------gap_heatmap.Rd(1008B)
--------as.gapdata.Rd(638B)
--------get_most_left_leaf.Rd(408B)
--------map.Rd(584B)
--------count_gap.Rd(571B)
--------assign_positions.Rd(602B)
--------get_most_right_leaf.Rd(415B)
--------gap_data.Rd(1KB)
--------is.gapdata.Rd(378B)
--------set_most_right_leaf.Rd(566B)
--------gapmap-package.Rd(1KB)
----README.md(351B)
----inst()
--------.DS_Store(6KB)
----DESCRIPTION(956B)