基序分类:使用从Sequitur处理SAX离散化数据中发现的基序对时间序列数据进行分类

时间:2024-02-26 14:23:51
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文件名称:基序分类:使用从Sequitur处理SAX离散化数据中发现的基序对时间序列数据进行分类

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更新时间:2024-02-26 14:23:51

time-series scikit-learn classification sequitur motif-discovery

安装 文法 我的代码包装了GrammarViz中的代码。 要使用它,您首先需要运行: git clone https://github.com/GrammarViz2/grammarviz2_src.git cd grammarviz2_src mvn package -Psingle ...制造罐子。 我写了一个实现scikit-learn BaseEstimator接口的包装器,以便可以将scikit的Pipeline和GridSearchCV用于交叉验证参数网格搜索。 为了允许包装器找到GrammarViz代码,您有两个选择。 您可以添加一个环境变量,如下所示: export GRA


【文件预览】:
motif-classify-master
----grid_search.sh(248B)
----compute_accuracies.sh(562B)
----pysax.py(8KB)
----requirements.txt(33B)
----motif_finder.py(6KB)
----grammar_parser.py(6KB)
----LICENSE(1KB)
----grid_search.py(2KB)
----cli.py(1KB)
----readme.md(4KB)
----data.zip(5.22MB)
----motif_tagger.py(4KB)

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