文件名称：ggmotif:在ggplot中添加DNA序列基序
文件大小：28KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-31 18:53:24
visualization bioinformatics r R
ggmotif 在ggplot中添加DNA序列基序 受到seqLogo Bioconductor软件包的启发，并以其为基础。 在ggplot2框架中绘制DNA序列基序。 使用devtools::install_github安装（不在CRAN上）。 创建独立图，或在特定位置以特定大小在ggplot中添加序列徽标。 library(ggmotif) #> Loading required package: ggplot2 ggmotif_plot("ACGWRT") 也可以使用位置频率矩阵代替字符串： mat = Biostrings::consensusMatrix("ACGWRT") mat #> [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] #> A 1 0 0 0 0 0 #> C 0 1 0
【文件预览】：
ggmotif-master
----README.Rmd(1KB)
----man()
--------ggmotif_theme.Rd(437B)
--------ggmotif_plot.Rd(758B)
--------ggmotif_scale.Rd(322B)
--------ggmotif.Rd(915B)
----NAMESPACE(180B)
----README-example_ggmotif_plot2-1.png(6KB)
----LICENSE(49B)
----.Rbuildignore(59B)
----README-example_ggmotif-1.png(8KB)
----.gitignore(43B)
----README-example_ggmotif_plot-1.png(6KB)
----R()
--------motif_plot.R(3KB)
--------plot_theme.R(1KB)
--------makeLetter.R(3KB)
--------toPolygon.R(2KB)
--------ggmotif.R(162B)
--------utils.R(1KB)
----DESCRIPTION(421B)
----README.md(1KB)