gibbs-sampler-motif-finding:用于在 DNA 序列中寻找基序的吉布斯采样器

时间:2024-07-11 07:35:37
【文件属性】:

文件名称:gibbs-sampler-motif-finding:用于在 DNA 序列中寻找基序的吉布斯采样器

文件大小:7KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-11 07:35:37

Python

吉布斯采样器主题发现 这个 python 脚本是用于在字符序列中查找模式的 gibbs 采样的实现。 一个流行的例子是在 DNA 序列中找到基序。 从另一个脚本运行 首先,导入模块 gibbs 然后调用带有参数序列和字长的方法采样,输出是每个序列的单词位置 有关代码的更多解释(印度尼西亚语),请参阅 。


【文件预览】:
gibbs-sampler-motif-finding-master
----sampling.py(524B)
----sequence_generator.py(3KB)
----test.py(1000B)
----gibbs_sampler1.py(3KB)
----README.md(493B)
----gibbs_sampler2.py(3KB)
----gibbs.py(4KB)

网友评论