文件名称:MetaMap2PubAnnotation:MetaMap2PubAnnotation是使用MetaMap API连接到MetaMap,使用UMLS概念ID标记提供的文本文档并生成PubAnnotation格式的JSON文件的工具
文件大小:117KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-01 09:21:44
Java
MetaMap2PubAnnotation MetaMap2PubAnnotation是一个使用MetaMap API连接到MetaMap,使用UMLS概念ID标记提供的文本文档并生成PubAnnotation格式的JSON文件的工具。 工具是用Java编写的,并依赖于它。 怎么跑 该工具使用4个命令行参数: MetaMap服务器的主机 端口号-元图服务器的默认端口号是8066,因此您可以使用该端口号 包含文件的目录。 使用文件名作为PubAnnotation格式的sourceid的工具 sourcedb的名称-通常是PMC或PubMed 命令行示例: java -jar MetaMap2PubAnnotation.jar localhost 8066 example/ PMC
【文件预览】:
MetaMap2PubAnnotation-master
----.project(375B)
----output()
--------26515032.json(79KB)
----src()
--------MetaMat2PubAnnot.java(6KB)
----lib()
--------MetaMapApi.jar(48KB)
--------json-simple-1.1.1.jar(23KB)
--------prologbeans.jar(26KB)
----.settings()
--------org.eclipse.jdt.core.prefs(587B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(654B)
----data()
--------26515032.txt(1KB)
----.classpath(471B)
----bin()
--------MetaMat2PubAnnot.class(8KB)