文件名称:TandemTools:评估在超长串联重复中提高装配质量的工具
文件大小:13.14MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-09 21:55:05
C++
快速开始 tandemquast.py --nano test_data/simulated_reads.fasta test_data/simulated_polished.fa -o simulated_res 介绍 TandemTools封装包括TandemQUAST工具用于评估和改进超长串联重复序列(ETR)和TandemMapper工具的组件用于映射长容易出错读取到ETRS。 注意:TandemTools专为ETR设计(长度范围从数十万到数百万个核苷酸)。 强烈建议不要在较短的TR上运行TandemTools。 安装 需求列在requirements.txt ,可以通过Conda作为conda install --file requirements.txt 。 用法 tandemquast.py [options] --nano/--pacbio < reads_fil