文件名称：GCsnap:GC快照
文件大小：20.69MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-20 14:22:52
Python
GC快照 GCsnap是一个灵活的基于Python的工具，它允许在任何分类学水平上交互比较来自任何基因组的蛋白质编码基因的基因组背景，并将它们与所示任何基因的功能和结构信息整合在一起。 通过将输出连接到不同的蛋白质数据库，用户可以从一个简单的交互平台浏览不同的基因组背景，从而有助于对发现的背景进行进一步的分析。 GCsnap不限于单一输入格式，可以执行批处理作业并接受蛋白质分类图。 所有信息都存储在详细的，人机可读的文件中，以及可定制的出版物就绪图。 依存关系 GCsnap用Python 3.7编写，应在Python 3.x上运行。 它已在Python 3.7和3.8上进行了测试。 它主要需要核心Python模块，并且只需要三个外部软件包： 生物蟒 散景 Networkx 有关详细要求，请查看requirements.txt 。 此外，GCsnap依赖于BLASTp和PsiBl
【文件预览】：
GCsnap-master
----tutorial()
--------1_gcsnap_interactive_output_small.mov(7.98MB)
----LICENSE(34KB)
----requirements.txt(105B)
----examples()
--------yqlc_KHII()
--------ybez_KHI()
--------Fig2.png(338KB)
--------Fig1.png(1.31MB)
--------Fig1.pdf(4.14MB)
----setup.py(1KB)
----README.md(6KB)
----gcsnap()
--------GCsnap.py(121KB)
--------__init__.py(92B)