文件名称：生物信息学
文件大小：1.28MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-18 12:54:51
Python
生物信息学 编辑百分比： 对于参考miRNA数据库中核苷酸的每种组合以及在测序中发现的核苷酸，包含在比对读数中发现的变化列表的文件。 基因计数和差异表达： 使用BISEK进行差异表达分析的图表。 还包含通过将测序的Mirna与参考miRNA数据库比对创建的基因计数 公用事业： 用于生成编辑百分比和对齐数据的实用程序功能 Generate_Edit_Counts_And_Percents.py： 编写代码以从对齐文件中获取编辑计数和百分比。 mirna_pipeline.py： 将阅读文库与参考，比对产生，基因计数产生比对
【文件预览】：
BioinformaticsProject236524-main
----Editing Percents()
--------positive_edit_pcts.T_A_edit_pct(85KB)
--------positive_edit_pcts.A_G_edit_pct(154KB)
--------positive_edit_pcts.C_A_edit_pct(31KB)
--------positive_edit_pcts.A_C_edit_pct(62KB)
--------positive_edit_pcts.A_T_edit_pct(110KB)
--------positive_edit_pcts.G_C_edit_pct(137KB)
--------positive_edit_pcts.T_G_edit_pct(130KB)
--------positive_edit_pcts.C_G_edit_pct(50KB)
--------positive_edit_pcts.G_T_edit_pct(47KB)
--------positive_edit_pcts.G_A_edit_pct(80KB)
--------positive_edit_pcts.T_C_edit_pct(87KB)
--------positive_edit_pcts.C_T_edit_pct(32KB)
----Utility()
--------fastq_seq_size_filtering.py(8KB)
--------aligner_wrapper.py(10KB)
--------generators_utilities.py(10KB)
--------parallel_generator.py(4KB)
--------Annotated_Sequence_Class.py(2KB)
--------Fastq_class.py(3KB)
--------Pileup_class.py(6KB)
----Generate_Editing_Counts_And_Percents.py(23KB)
----Gene Counts and Differential Expression()
--------padeto_without_11311.png(208KB)
--------n2bb21PCA.png(899KB)
--------summary_no11311.JPG(41KB)
--------ma_without_11311.png(21KB)
--------significant_mirnas.txt(2KB)
--------table_without_11311.csv(44KB)
--------histogramwithout11311.png(177KB)
--------Gene Counts()
----README.md(782B)
----mirnaproject.docx(131KB)
----mirna_pipeline.py(5KB)