tophat 给于bowtie的序列map工具

时间:2016-04-14 11:55:56
【文件属性】:

文件名称:tophat 给于bowtie的序列map工具

文件大小:12.01MB

文件格式:GZ

更新时间:2016-04-14 11:55:56

map工具

reads map 到reference基因组的工具,常用于RNA-Seq中,主要给于bowtie的比对方法,安装时首先需要安装bowtie


【文件预览】:
tophat-2.0.6.Linux_x86_64
----bed_to_juncs(2KB)
----tophat(164KB)
----bam_merge(1.84MB)
----gtf_to_fasta(2.56MB)
----gtf_juncs(2.37MB)
----bam2fastx(958KB)
----juncs_db(2.47MB)
----README(1KB)
----segment_juncs(7.46MB)
----sam_juncs(3.43MB)
----contig_to_chr_coords(5KB)
----prep_reads(2.68MB)
----AUTHORS(634B)
----tophat-fusion-post(78KB)
----map2gtf(2.6MB)
----sra_to_solid(716B)
----tophat_reports(7.08MB)
----long_spanning_reads(5.97MB)
----fix_map_ordering(1.75MB)
----COPYING(5KB)
----tophat2(233B)

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