NDDVD:集成且手动管理的神经退行性疾病变异数据库

时间:2024-05-02 20:43:06
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文件名称:NDDVD:集成且手动管理的神经退行性疾病变异数据库

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更新时间:2024-05-02 20:43:06

研究论文

神经退行性疾病(NDD)与遗传变异有关,包括点取代,拷贝数改变,插入和缺失。 目前,已经为一些单独的NDD创建了一些遗传变异库,但是,需要将这些数据库整合并扩展到所有NDD,以进行系统生物学研究。 我们在这里建立一个称为NDDVD的关系数据库,以使用Leiden开放变异数据库(LOVD)平台集成所有NDD的变异。 NDDVD中的项目是从PubMed手动收集的,或者是从现有的变体数据库中提取的。 跨疾病数据库包括与37个不同NDD相关的289个基因的6374个以上的遗传变异。 统计比较了不同NDD中的变异的模式,保守性和生物学功能,并为NDDVD提供了用户友好的界面,网址为:http://bioinf.suda.edu.cn/NDDvarbase/LOVDv.3.0。


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