文件名称:lec_gly_binding
文件大小:799KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-20 06:40:54
R
聚糖结合 计划识别和定位凝集素结合位点的特征以及对特定聚糖的亲和力或特异性的关联 概述 包依赖 目录结构 分析笔记 包依赖 用于进行此分析的脚本与以下软件包一起运行: R版本3.3.2 ggplot2 2.2.1 重塑2 1.4.3 的Python 3.7.6 rdkit 2019.09.3 lxml 4.5.0 生物Python1.76 [PLIP v1.4.5在Python 2.7.17上运行]使用从v1.4.5修改而来的PLIP的自定义版本,可以在以下位置找到: : openbabel 2.4.1
【文件预览】:
lec_gly_binding-master
----.gitignore(125B)
----scripts()
--------uniLec_survey.R(7KB)
--------genSplitPDBlists.py(1KB)
--------manualBSfilter.py(10KB)
--------prediction()
--------wholeSequence.py(2KB)
--------fine_specificity-NeuGc_Ac.R(31KB)
--------chainClusts2seqs.py(3KB)
--------future()
--------fine_specificity-lactose.R(54KB)
--------pocketAnalysis()
--------bashScripts()
--------fine_specificity-NeuAc23_26.R(87KB)
--------misc()
--------lec_gly.py(15KB)
--------checkPLIPligands.py(61KB)
--------prelim()
--------bSiteResiFeatures.py(18KB)
----README.md(637B)