文件名称：higlass-transcripts:HiGlass的基因转录本追踪
文件大小：2.21MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-28 14:41:06
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HiGlass笔录曲目 在HiGlass中显示基因转录本！ 缩小： 放大： 注意：这仅是脚本轨道的源代码！ 您可能还想查看以下存储库： HiGlass查看器： : HiGlass服务器： ： HiGlass码头工人： : 安装 npm install higlass-transcripts 资料准备 要从Gencode GTF文件中提取转录数据，可以使用以下脚本（确保在脚本中调整文件名） python /scripts/extract_transcript_data.py 要从该数据创建聚合的beddb文件，可以使用脚本 python /scripts/aggregate_transcripts.py 可以在examples文件夹中找到示例bed和beddb文件。 要将数据提取到higlass-server中，请执行以下操作： python manage.py i
【文件预览】：
higlass-transcripts-master
----.gitignore(122B)
----karma.conf.js(2KB)
----README.md(4KB)
----CHANGELOG.md(253B)
----.github()
--------workflows()
----test()
--------TranscriptsTests.js(2KB)
--------utils()
--------SVGExportTests.js(2KB)
--------AminoAcidTests.js(2KB)
--------mocked-responses()
--------view-configs()
----examples()
--------transcripts_test.beddb(3.22MB)
--------transcripts_test.txt(2.03MB)
----LICENSE(1KB)
----package.json(3KB)
----svg-image.svg(1018B)
----src()
--------index.js(195B)
--------scripts()
--------index.html(8KB)
----.babelrc(103B)
----scripts()
--------aggregate_transcripts.py(14KB)
--------extract_transcript_data.py(8KB)
--------commands.txt(710B)
----images()
--------tyr.png(40KB)
--------asn.png(41KB)
--------asp.png(45KB)
--------gln.png(41KB)
--------lys.png(34KB)
--------arg.png(40KB)
--------val.png(37KB)
--------gly.png(42KB)
--------leu.png(37KB)
--------met.png(36KB)
--------cys.png(42KB)
--------trp.png(36KB)
--------ser.png(38KB)
--------glu.png(43KB)
--------ile.png(38KB)
--------pro.png(44KB)
--------thr.png(33KB)
--------phe.png(35KB)
--------his.png(35KB)
--------ala.png(43KB)
----webpack.config.js(4KB)
----package-lock.json(627KB)