SQANTI3:长读长定义转录组的质量控制工具

时间:2024-08-12 06:13:41
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文件名称:SQANTI3:长读长定义转录组的质量控制工具

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更新时间:2024-08-12 06:13:41

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SQANTI3 SQANTI3 是 SQANTI 工具()的最新版本,它合并了 SQANTI()和 SQANTI2()的功能以及新增功能。 SQANTI3 将继续作为一项集成开发,旨在为您的新长读定义转录组提供最佳表征。 SQANTI3 是框架的第一个模块,其中还包括 IsoAnnot 和 tappAS。 最新更新 当前版本 (07/05/2021):SQANTI3 版本 4.1 SQANTI3 中实现的新功能 4.1 版: 更改--gtf参数。 现在,默认情况下,SQANTI3 需要一个 GTF 文件作为输入。 通过激活--fasta选项,仍然可以将同种型的序列作为 FASTA 或 FASTQ 文件提供。 修复了报告的新情节和小错误。 4.0 版: 创建 HTML 报告。 使用--report参数,可以选择报告的类型: html (默认)、 pdf 、 both或skip


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