文件名称:GENSENG:GENSENG 是一款从 NGS 数据中检测 CNV 的软件-开源
文件大小:2.88MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-18 19:47:43
开源软件
GENSENG 是一种从 NGS(下一代测序)数据中检测 CNV(拷贝数变异)的软件。 我们已经上传了数据准备代码。 请从 Files 文件夹下载。
【文件预览】:
R-GENSENG1.0.2
----data_examples()
--------wes.txt(315KB)
--------wgs.txt(12.71MB)
----.DS_Store(6KB)
----configs()
--------transition_init.dat(628B)
--------.DS_Store(6KB)
--------config.example(1KB)
--------config.callingwes.example(1KB)
--------config.callingwgs.example(1KB)
----src()
--------HMM.cpp(20KB)
--------Input.cpp(3KB)
--------CNV.cpp(11KB)
--------LICENSE.txt(34KB)
--------Regression.cpp(9KB)
--------Input.h(4KB)
--------Output.h(2KB)
--------GENSENG.cpp(8KB)
--------HMM.h(3KB)
--------Console.cpp(639B)
--------makefile(351B)
--------MathTools.cpp(83KB)
--------Regression.h(2KB)
--------CNV.h(4KB)
--------MathTools.h(6KB)
--------GENSENG.h(1KB)
--------Output.cpp(3KB)
----analysis_result()
----analysis_debugging_info()
----.README.swp(16KB)
----README(7KB)
----running_examples()
--------run_wgs_analysis_example.sh(145B)
--------run_wes_analaysis_example.sh(145B)