工具箱:使用Python进行NGS分析的工具箱

时间:2024-02-26 11:18:50
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文件名称:工具箱:使用Python进行NGS分析的工具箱

文件大小:249KB

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更新时间:2024-02-26 11:18:50

bioinformatics rna-seq ngs project-management chip-seq

ngs-toolkit 这是我的NGS分析工具包: ngs_toolkit 。 转至以了解如何安装和使用该工具包,并查看可用功能的目录。 安装方式: pip install ngs-toolkit 您可能需要在上述命令中添加--user标志。


【文件预览】:
toolkit-master
----requirements()
--------requirements.single_cell.txt(182B)
--------requirements.txt(319B)
--------requirements.docs.txt(75B)
--------requirements.test.txt(90B)
----Manifest.in(111B)
----ngs_toolkit()
--------exceptions.py(2KB)
--------chipseq.py(31KB)
--------recipes()
--------project_manager.py(13KB)
--------rnaseq.py(25KB)
--------general.py(87KB)
--------decorators.py(5KB)
--------utils.py(43KB)
--------graphics.py(27KB)
--------analysis.py(248KB)
--------__init__.py(8KB)
--------demo()
--------config()
--------track_manager.py(14KB)
--------tests()
--------.readthedocs.yml(524B)
--------templates()
--------parsers.py(3KB)
--------cnv.py(37KB)
--------constants.py(507B)
--------atacseq.py(96KB)
----.github()
--------workflows()
----Dockerfile(1KB)
----.gitpod.yml(147B)
----LICENCE.txt(34KB)
----.travis.yml(2KB)
----setup.cfg(84B)
----setup.py(3KB)
----README.md(1KB)
----Makefile(2KB)
----docs()
--------source()
--------Makefile(7KB)
----.readthedocs.yml(644B)
----.gitignore(884B)

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