文件名称:gesso:开发该软件包以适合正则化回归模型,我们将其称为gesso [G(by)E(la)sso],用于联合选择基因与环境(GxE)的相互作用
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更新时间:2024-04-24 04:59:50
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格索 开发该软件包的目的是为了适应我们称为gesso的正态回归模型,该模型用于联合选择基因与环境(GxE)的相互作用。 该模型集中于单个环境暴露,并引发“交互之前的主要作用”层次结构。 我们开发并实施了一种高效的拟合算法和筛选规则,可以高精度地丢弃大量不相关的预测变量。 gesso模型通过重叠的组套索结构来诱导(GxE)交互项的层次选择。 该模型具有两个调整参数λ1和λ2,可以灵活地根据数据控制组稀疏性和其他交互稀疏性。 介绍 可以使用gesso包 以“相互作用前的主要作用”分层方式选择基因-环境相互作用项 用于建立包含特定感兴趣的交互作用项的结构良好的联合预测模型,其中最终预测模型仅包括交互作用项,其各自的主要影响也包括在模型中 该包装支撑件稀疏矩阵dgCMatrix并从(filebacked)bigmatrix格式bigmemory包大或缩小RAM数据集。 Tha包允许向模型添加未