文件名称：ims-ms-analyse:离子淌度质谱数据分析工具
文件大小：9.07MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-15 21:03:20
Python
ims-ms-analyse 质量/电荷/迁移率/强度（“ m / z”，“ Z”，“ DT”，“ cts”）色谱峰选择。 包括用于离子淌度质谱分析管道的工具，包括数据清除，自动化，绘图等。 当前支持使用Waters TWIMS（.raw）文件进行峰采集和数据提取。 指示 将DriftScope 2.9安装到默认目录：“ C：\ DriftScope” 请注意，如果未安装此程序，则该程序将不会运行基于色谱的IMS峰采集，因为需要专有DLL文件。 通过运行./setup.py安装Python 3.9和依赖项。 为了提取数据，将Waters IMS-MS文件（.RAW）复制到所需目录，然后复制完整的数据目录路径。 apex3D_extraction出现提示时，输入包含任意数量的Waters（.raw）实验数据文件的目录，然后按Enter。 默认情况下，每个实验的数据都会作为原始数据（
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ims-ms-analyse-main
----plotting()
--------todo - Altair interactive scatter()
--------Figure 2()
--------Figure 5()
--------datashader-plot.py(2KB)
--------Figure 4()
--------Supporting Information()
--------Figure 3()
--------Figure 6()
--------PowerBI-dashboard.pbix(493KB)
--------__init__.py(57B)
--------colour_keg.py(612B)
--------Figure 1()
--------import-twimextract.py(2KB)
--------2D-TWIMS-plot()
--------Figure 7()
----make-requirements.py(176B)
----__init__.py(57B)
----ms_io.py(289B)
----get_raw_exp_info.py(0B)
----LICENSE(1KB)
----SAMM3Dextract()
--------SAMM3Dextract.py(5KB)
--------Apex3D-README(727B)
----apexdata_handler_local.py(2KB)
----setup.py(353B)
----README.md(940B)
----SAMMmonitor()
--------SAMMmonitor-Combine(190220).py(586B)
--------removed.py(3KB)
--------0-Archive()
--------SAMMmonitor.py(10KB)
--------SAMMmonitor-121219.py(9KB)
--------SAMMmonitor-testing.py(9KB)
--------TWIMMonitor-EJ100719.py(7KB)
----file(5B)
----apex_data_handler.py(3KB)
----templates()
--------pythonTemplate.py(345B)
--------script-template.py(722B)
----.gitignore(2KB)
----rules()
--------SAMM2D-Z1-RuleFile.rul(4KB)
--------Selection Rule-PMo12-34ms-mz911.rul(3KB)
--------SAMM2D-Z2-RuleFile.rul(4KB)
--------SR-PMo12-34ms-mz911.rul(3KB)
----multispec_trend.py(5KB)