文件名称：matlabfcm函数代码-clustering:探索聚类方法的项目
文件大小：11.17MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 00:52:44
系统开源
matlab fcm函数代码聚类 探索聚类方法的项目 背景 该存储库包含Matei关于群集的Rmd讲座。 我还建议您下载Young / Old FlowRepository数据集。 为此： 安装FlowRepositoryR软件包 使用该程序包，检索FR-FCM-ZZGS数据集 查看此git存储库中的代码，以获取有关如何进行质量控制和数据预选门的建议/指导 之后，玩得开心！ 尝试FlowSOM。 考虑一下您自己的聚类和总体识别想法。 寻找在新老受试者之间差异显着的T细胞亚群。 年轻/旧数据集 该数据集由美国纽约州罗彻斯特市的David H. Smith疫苗生物学与免疫学中心罗彻斯特人体免疫学中心创建。 目的是使用SWIFT的竞争性聚类分配方法来测量老年人/年轻人中PBMC亚群之间的差异。 SWIFT是一种非常好的聚类方法，可在MATLAB中实现，如所述。 不幸的是，由于它是在MATLAB（这是一个可商购的系统）中实现的，因此您可能无法自己运行它。 但是，您可以将结果与已发布的SWIFT结果进行比较。 质量控制和门控 此仓库中包含三个包含我的R代码的文件。 yo_utils.R 该文件包
【文件预览】：
clustering-master
----clustering_flow.Rmd(14KB)
----qc_raw.png(417KB)
----README.html(1.84MB)
----qc_gated.png(447KB)
----figs_for_clustering.R(7KB)
----get_yo_dataset.R(357B)
----README.md(6KB)
----gate_data.R(1KB)
----yo_utils.R(32KB)
----clustering_flow.html(12.89MB)
----survey_data.R(6KB)