文件名称:bistro:一个用于构建和执行类型化科学工作流程的库
文件大小:176KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-24 06:35:36
workflow bioinformatics pipeline ocaml computational-biology
小酒馆:构建和运行分布式工作流 bistro是库,用于构建和运行由一系列相互依赖的脚本表示的计算,这在应用研究(尤其是计算生物学)中经常发现。 特点: 以声明方式构建复杂且可组合的工作流 简单轻便地包裹新组件 恢复失败:如果失败,请修复它,然后工作流将从停止的地方重新开始 分布式工作流执行 开发友好:修改脚本后,小酒馆会自动找出需要重新计算的内容 自动命名生成的文件 静态类型:在编译时检测文件格式错误! 该库提供表示脚本(包括元数据和依赖项)的数据类型,运行工作流的引擎以及提供流行工具组件的标准库(尽管目前主要与计算生物学和Unix相关)。 欢迎提出问题,建议或贡献,请根据需要提出。 文献资料 可以使用,但是如果不清楚或遗漏任何东西,请随时提出问题。 还有一个。 安装 中提供了详细说明。 概括地说, bistro可以使用安装 。 您需要最近安装(至少为4.03.0)的OCaml。