【文件属性】：
文件名称：CRISPRforecast:CRISPR预测
文件大小：365KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-03-21 15:40:43
JupyterNotebook
CRISPRforecast：预测CRISPR / Cas9系统中高目标sgRNA活性的有效方法
作者：Zahid Hossain，Sajid Ahmed，Shafayat Bin Sabbir，Atikul Islam Sajib，Md Rafsan Jani，Sheikh Adilina，Dewan Md。Farid，Abdollah Dehzangi和Swakkhar Shatabda
网站链接： :
结构：
原始数据集存储在“数据”文件夹中。
模型和特征生成代码存储在“代码”文件夹中。
所有必需的图都存储在“图和图”文件夹中。
使用CRISPRforecast：
从“ requirements.txt”安装必要的软件包
为了生成特征，请使用“数据”文件夹中提供的数据集。
将Feature_Generation.ipynb和Original_Dataset.csv文件放在同一文件
【文件预览】：
CRISPRforecast-master
----requirements.txt(5KB)
----graphs and diagrams()
--------CRISPR Research Diagram 2.png(54KB)
--------Target Genes Nucleotide Counts.png(45KB)
--------auPR.png(21KB)
--------Feature Importance.png(41KB)
--------auROC.png(18KB)
----README.md(1KB)
----data()
--------Original Dataset.csv(445KB)
----codes()
--------CRISPR_Feature_Extraction_KPCA_Linear.ipynb(48KB)
--------CRISPR_Feature_Extraction_KPCA_Poly.ipynb(49KB)
--------CRISPR_Feature_Selection_RFC.ipynb(49KB)
--------Feature_Generation.ipynb(19KB)
--------CRISPR_No_Feature_Reduction.ipynb(48KB)