文件名称：CRISPR工具：CRISPR屏幕分析管道
文件大小：36.19MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-12 15:29:21
bioinformatics-pipeline crispr-screens-pipeline Shell CRISPR屏幕生物信息流水线 该生物信息学管道将自动执行来自CRISPR-Cas9筛选实验的NGS数据分析。 它使用MAGeCK进行统计分析。 软件依赖项： Python 3 大熊猫 脾气暴躁的 Matplotlib 海生 [R 快速质量控制 多质量控制 领结2 Cutadapt Pigz（如果未安装，将使用gunzip，但速度会较慢） 麦格克 说明： 从命令行安装： git clone https://github.com/niekwit/CRISPR-tools.git 为包含子文件夹raw-data的分析创建一个主文件夹（可以是任何名称），该子文件夹包含fastq.gz文件。 导航至命令行中的分析文件夹，然后键入： path/to/crispr-pipeline.sh [ -l