文件名称：matlab代码sqrt-FIGR:基因调控的快速推断-一种基于分类的有监督的基因调控网络动力学模型的推断方法
文件大小：555KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 15:41:51
系统开源
Matlab代码sqrt 战斗机 基因调控的快速推断-一种基于监督的基于分类的方法，用于推断基因调控网络的动力学模型。 版本0.2 David Fehr，Manu和Yen Lee Loh 北达科他大学 2019-04-24 关于 FIGR推断基因调控网络（GRN）的微分方程模型的参数值。 耦合的微分方程称为基因电路，代表具有调节器浓度的开关样功能的基因产物合成，作为一级过程的产物降解和作为Fickian扩散的产物转运。 参见或对基因电路模型的描述。 当前，FIGR能够在两种情况下推断基因电路模型： 单个细胞中的GRN，具有一个或多个条件下的基因表达时间序列数据。 一维细胞中的GRN，具有来自每个细胞的基因表达时间序列数据以及通过Fickian扩散在细胞之间传递基因产物。 快速入门指南 将所有文件下载到同一目录中。 启动MATLAB，然后 cd到包含文件的文件夹，或者 使用addpath()将目录添加到MATLAB路径。 在MATLAB命令行上，运行提供的示例脚本之一，例如example1_simple 。 脚本在“命令”窗口中打印文本，并弹出“图形”窗口。 如果需要，请检查由全局工作区
【文件预览】：
FIGR-master
----refineFIGRParams_mex.mexa64(264KB)
----unpackParams.m(749B)
----fly_xntg.txt(20KB)
----refineFIGRParams_mex.mexmaci64(252KB)
----RateofChange.m(5KB)
----computeTrajs.m(5KB)
----example3_fly.m(7KB)
----fly_tt.txt(75B)
----initChiSquare.m(4KB)
----build_refineFIGRParams_MEX.m(3KB)
----example1_simple.m(4KB)
----README.md(7KB)
----packParams.m(357B)
----infer.m(34KB)
----refineFIGRParams_mex.mexw64(574KB)
----example2_extreg.m(5KB)
----refineFIGRParams.m(3KB)