文件名称：CPAG:GWAS 的交叉表型分析-开源
文件大小：72.18MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 22:01:16
开源软件
CPAG（GWAS的Cross-Phenotype Analysis）可以估计疾病和性状的相似性，识别信息丰富的疾病簇，并进行通路富集分析。 它还以分层聚类树、热图和网络的形式提供这些结果的可视化。
【文件预览】：
CPAGv0.2_mac
----cpaglib()
--------c6.all.v4.0.symbols.gmt(207KB)
--------GWASSep4_2013_1000G_EUR.ld_rsquare0.6(28.08MB)
--------c5.all.v4.0.symbols.gmt(943KB)
--------ReactomePathways.gmt(479KB)
--------GWASSep4_2013_1000G_EUR.ldslim(414KB)
--------cpag.dmain(576KB)
--------c3.all.v4.0.symbols.gmt(1.25MB)
--------GenSigDB.v4.0.gmt(2.73MB)
--------GWASCatalog2013Sep4.txt(2.31MB)
--------GWASCatalog2013Sep4_p1e-7.txt(1.04MB)
--------GWASSep4_2013_1000G_EUR.ld.gz(15.08MB)
--------GWASCatalogSep4_2013.snps.annot(729KB)
--------c4.all.v4.0.symbols.gmt(601KB)
--------cpag.dmat(346KB)
--------IFNstimgenes.gmt(3KB)
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--------c1.all.v4.0.symbols.gmt(238KB)
--------c7.all.v4.0.symbols.gmt(2.55MB)
----test()
--------example.networkdegree.infile(3KB)
--------example.txt(3KB)
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--------example.heatmap.ChaoSorensen(1.4MB)
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----cpag.ico(198KB)
----.DS_Store(6KB)
----CPAGv0.2_mac(45.21MB)