文件名称：selene:训练序列级深度学习网络的框架
文件大小：13.55MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-03 00:42:55
deep-learning genomic-data-analysis sampling-methods JupyterNotebook
Selene是一个Python库和命令行界面，用于从生物序列数据（如基因组）中训练深度神经网络。 安装 我们建议在Python 3.6或更高版本中使用Selene。 使用以下任何一种方法（conda，pip，source），软件包安装只需几分钟（不到10分钟，通常为2-3分钟）。 首先，安装 。 如果您具有NVIDIA GPU，请安装支持该版本的PyTorch-使用独立的GPU，Selene的运行速度会更快。 该库当前与0.4.1至1.4.0之间的PyTorch版本兼容。 我们将继续更新Selene，使其与最新版本的PyTorch兼容。 使用安装selene（对于Linux）： conda install -c bioconda selene-sdk 用pip安装selene： pip install selene-sdk 请注意，我们不建议您点安装旧版本的Selene（低于0.4.0