【文件属性】:
文件名称:metagenomics_halophytes:https的元基因组学工作流程
文件大小:4.53MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-04-29 02:54:39
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盐生植物根际中的元条形码
Miguel Camacho Sanchez,JoséM.Barcia-Piedras,SusanaRedondo-Gómez,Maria Camacho(2020)地中海季节和盐生植物Arthrocnemum macrostachyum确定了西班牙西南部盐沼土壤中的细菌群落。 应用土壤生态学。 doi:
补充方法
作者:Miguel Camacho-Sanchez 2018年10月4日
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE,eval=F)
1.整理序列
Cutadapt 1.8.3用于分别从R1和R2读物中修剪F341(CCTACGGGNGGCWGCAG)和R785(GACTACHVGGGTATCTAATCC)引物(Klindworth et al.2013)。 列出目录ls所有文件:
ls | grep R[1-2].fas
【文件预览】:
metagenomics_halophytes-master
----LICENSE(1KB)
----.gitignore(500B)
----metarizo.html(3.59MB)
----README.md(26KB)
----Camacho-Sanchez_2020_ASE.pdf(2.39MB)