文件名称：mhcflurry:肽-MHC I结合亲和力预测
文件大小：4.6MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-25 04:02:34
Python
制浆 配体预测软件包具有极高的准确性和快速而有实施方案。 MHCflurry实施I类肽/ MHC结合亲和力预测。 当前版本提供了支持任何已知序列MHC等位基因的pan-MHC I预测因子。 MHCflurry使用神经网络库在Python 3.4+上运行。 它公开了和接口。 从版本1.6.0开始，MHCflurry还包括两个实验性预测因子，一个“抗原加工”预测因子试图模拟MHC等位基因无关的效应，如蛋白体切割，另一个“表现形式”预测因子将加工过程预测与结合亲和力预测相结合，从而得到一个综合“表现得分”。 两种模型均经过质谱鉴定的MHC配体训练。 这些模型已更新，以合并MHCflurry 2.0版本的较小改进。 如果您发现MHCflurry对您的研究有用，请引用： T. O'Donnell，A。Rubinsteyn和U. Laserson。 “MHCflurry 2.0：MHC的改进的