epitopepredict:用于表位预测的Python软件包和命令行工具

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文件名称：epitopepredict:用于表位预测的Python软件包和命令行工具
文件大小：11.46MB
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更新时间：2021-05-18 23:50:10
bioinformatics immunology epitope-prediction-methods JupyterNotebook 背景 epitopepredict提供了用于执行多种表位预测方法的标准化程序界面和命令行工具。 当前，这主要由几个MHC结合预测的接口组成，然后可以以一致的方式处理和可视化其结果。 有一种用于MHC I类预测的内置方法，并且提供了TEPITOPEPan方法作为针对MHC II类的“内置”方法。 IEDB工具和netMHCpan，netMHCIIpan和MHCFlurry也受支持。 这些工具可免费用于学术用途，但必须单独安装。 该软件可在大多数linux系统上运行。 文档位于 安装 当前的版本： pip install epitopepredict 或github上的最新版本： pip install -e git+https://github.com/dmnfarrell/epitopepredict.git#egg=epitopepredict