ChromSCape:ChromSCape(单细胞染色质景观分析)

时间:2024-03-24 12:34:36
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更新时间:2024-03-24 12:34:36

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ChromSCape:使用Shiny App分析单细胞表观基因组数据集 什么是ChromSCape? ChromSCape-用于单细胞的染色质蛋白谱分析-是易于使用的,易于使用的Shiny应用程序,用于分析从对齐数据到差异数据的单细胞表观基因组数据集(scChIP-seq,scATAC-seq,scCUT&Tag等)。分析和基因组富集分析。 它具有高度的交互性,使用户可以保存他们的分析,并涵盖了广泛的分析步骤:质控,预处理,过滤,批处理校正,降维,虚拟化,聚类,差异分析和基因组分析。 启动ChromSCape ChromSCape需要R版本4.02 。 要安装ChromSCape ,请打开R或Rstudio并运行以下命令: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocM


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