文件名称:vcf2DIYABC.py:将vcf文件转换为基因型数据矩阵以输入DIYABC程序的脚本
文件大小:5KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-11 08:44:30
Python
vcf2DIYABC.py 目的 转换DIYABC输入文件中的VCF文件以获取SNP数据的工具 要求 python 2.x 分支python3.x上提供了与python 3.x兼容的版本。 Windows用户:如果您的计算机上未安装python,则此脚本无法运行。 我强烈建议您通过以下来完成此步骤,因为它可能对许多其他生物信息学目的很有用。 待办事项:我目前正在尝试生成一个自包含的可执行文件来运行脚本,而无需使用进行python安装。 下载/安装 如果git用户使用以下命令在其系统上安装了git,则可以克隆该存储库: git clone https://github.com/loire/vcf2DIYABC.snp.git 此存储库的zip归档文件的链接在此页面的右下角。 要安装,只需将存档解压缩到本地目录中即可。 用法 Unix和Mac用户可以使用终端和类型 python
【文件预览】:
vcf2DIYABC.py-master
----vcf2diyabc.py(6KB)
----README.md(2KB)
----example_data()
--------example.vcf(2KB)
--------individuals_information.txt(45B)