文件名称:clinspacy:使用spaCy,Scispacy和medspacy进行临床自然语言处理
文件大小:32.66MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-24 19:46:30
R
克林斯珀西 clinspacy的目标是使用Python spaCy,Scispacy和medspacy软件包执行生物医学命名实体识别,统一医学语言系统(UMLS)概念映射以及否定检测。 安装 您可以使用以下命令安装GitHub版本的clinspacy: remotes::install_github('ML4LHS/clinspacy', INSTALL_opts = '--no-multiarch') 如何加载clinspacy library( clinspacy ) 启动clinspacy 注意:安装软件包后,首次运行clinspacy_init()或clinspacy() ,您可能会收到一条错误消息,指出spaCy由于spaCy而无法导入。 重新启动R会话应该可以解决该问题。 启动clinspacy是可选的。 如果不使用clinspacy_init()初始化程序包,它将在
【文件预览】:
clinspacy-master
----_pkgdown.yml(0B)
----.github()
--------.gitignore(7B)
--------workflows()
----vignettes()
--------using_embeddings_for_machine_learning_on_clinical_text.Rmd(4KB)
--------.gitignore(11B)
----NAMESPACE(301B)
----CRAN-RELEASE(126B)
----README.html(191KB)
----NEWS.md(2KB)
----cran-comments.md(2KB)
----DESCRIPTION(1KB)
----clinspacy.Rproj(356B)
----R()
--------mtsamples.R(1KB)
--------utils-pipe.R(347B)
--------clinspacy.R(51KB)
--------utils-data-table.R(632B)
--------cui2vec_data.R(3KB)
----.Rbuildignore(169B)
----LICENSE(90B)
----LICENSE.md(1KB)
----README.md(113KB)
----data()
--------cui2vec_definitions.rda(30.47MB)
--------mtsamples.rda(3.35MB)
----man()
--------clinspacy.Rd(9KB)
--------bind_clinspacy_embeddings.Rd(3KB)
--------clinspacy_init.Rd(2KB)
--------bind_clinspacy.Rd(2KB)
--------dataset_cui2vec_embeddings.Rd(1KB)
--------dataset_mtsamples.Rd(1KB)
--------pipe.Rd(411B)
--------dataset_cui2vec_definitions.Rd(1KB)
----docs()
--------LICENSE.html(6KB)
--------index.html(157KB)
--------bootstrap-toc.css(2KB)
--------reference()
--------pkgdown.js(3KB)
--------pkgdown.css(7KB)
--------docsearch.js(2KB)
--------LICENSE-text.html(5KB)
--------docsearch.css(11KB)
--------news()
--------404.html(5KB)
--------pkgdown.yml(203B)
--------link.svg(810B)
--------authors.html(5KB)
--------bootstrap-toc.js(5KB)
--------articles()
----.gitignore(54B)
----README.Rmd(10KB)