matlab有些代码不运行-Zcells:来自明场显微镜Z堆栈图像的通用细胞分割

时间:2024-06-12 17:33:57
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文件名称:matlab有些代码不运行-Zcells:来自明场显微镜Z堆栈图像的通用细胞分割

文件大小:10.1MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-12 17:33:57

系统开源

matlab有些代码不运行Zcells Zcells是一种基于Z堆栈的显微图像分割技术,灵感来自高光谱成像。 有关同一内容的更多信息,请访问Wiki或在此处阅读相关文章:。 可以在以下位置找到经过整理的数据集:。 重要信息:我们强烈建议使用此存储库的randomforest分支,因为它的运行速度始终比master分支快。 另外,请使用最新的提交版本,而不是1.0版本,因为此后已纠正了许多错误。 我们即将发布1.1版,但在此之前我们仍想添加许多功能。 整个过程分为两个主要部分,训练和预测。 因此,有两个主要的用户脚本,training_script.m和prediction_script.m,我们将在以下各节中讨论。 有关每个函数及其采用和返回的参数的更多详细信息,您可以阅读源代码的相关部分,并在注释中进行说明。 训练阶段 要启动培训,只需移至Zcells文件夹的根目录,然后在Matlab中键入以下命令(需要R2017a版本或更高版本) training_script 标记Zstacks 将弹出一个GUI窗口,您可以在其中加载新的和未标记的Zstack,甚至可以加载一些已经标记的Zsta


【文件预览】:
Zcells-master
----prediction_script.m(2KB)
----utilities()
--------format_results.m(524B)
--------imborders.m(856B)
--------LoadAndExtract.m(6KB)
--------runthroughstack.m(7KB)
--------evalparams.m(503B)
--------tifToMatStack.m(2KB)
--------process_framessubselection.m(826B)
--------misc()
--------BundleData.m(1KB)
--------preprocessing.m(2KB)
--------saveResults.m(905B)
--------UnBundleData.m(579B)
--------process_subselection.m(824B)
--------plotConfMat.m(2KB)
----prediction()
--------predictionDisplayGUI()
--------RunPrediction.m(6KB)
----evalutation_script.m(5KB)
----README.md(4KB)
----training()
--------saveTrainedSet.m(1KB)
--------training.m(9KB)
--------trainingSetGUI()
--------createOrLoadTrainingSet.m(935B)
----training_script.m(995B)
----google_drive()
--------README.md(414B)
----.gitignore(355B)

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