文件名称：CelliD:从单细胞RNA-seq的单个细胞水平提取基因标记并进行细胞身份识别
文件大小：788KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-28 10:20:30
R
CelliD v0.99 R包，用于从单细胞RNA-seq的单个细胞水平提取基因签名和细胞身份。 欢迎来到在BioRxiv预印本展示的CelliD软件的官方Github存储库 概述 CelliD是一种强大的统计方法，可对单细胞RNA-seq数据集中的每个单个细胞执行基因签名提取和功能注释。 CelliD基于多重对应分析（MCA），可在低维空间中同时显示细胞和基因。 然后根据基因与每个单个细胞的距离对基因进行排序，从而提供无偏向的每个细胞基因签名。 事实证明，此类签名对于（i）在单个细胞分辨率下正确预测细胞类型标签，（ii）在独立数据集中正确匹配来自同一细胞类型的细胞，克服因不同技术，起源组织和供体产生的批次效应以及（iii）发现基于聚类的方法会遗漏的功能相关的细胞异质性。 CelliD能够可靠地鉴定稀有的甚至独特的细胞，其基因签名可在各种单细胞组学数据集中再现。 安装 CelliD最
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CelliD-master
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