文件名称：mytardis-mydata-parser:解析和过滤Illumina MiSeq测序运行结果
文件大小：26KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-23 19:59:38
Python
mytardis-mydata-parser mytardis-mydata-parser过滤器过滤并解析Illumina MiSeq运行结果，并通过mydata-python将其上传到MyTardis，然后将解析后的文件和原始文件移动到所需的备份位置。 依存关系 Python> = 3.6 Python依赖项是从requirements.txt pip install -r requirements.txt ： pip install -r requirements.txt git clone https://github.com/mytardis/mydata-python.git 如果在Linux上： cd mydata-python python setup.py install 使用python run.py [command]从Windows运行。 避开File
【文件预览】：
mytardis-mydata-parser-main
----.gitattributes(66B)
----.gitmodules(103B)
----run_miseq.py(898B)
----requirements.txt(1009B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(727B)
----run_server.py(267B)
----mytd_parser()
--------settings.py(980B)
--------parse_seq_run.py(35KB)
--------logger_settings.py(2KB)
--------__init__.py(0B)
--------parse_server_copy.py(6KB)
----.gitignore(1KB)