文件名称：gms:Genome Modeling System安装程序
文件大小：207KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-11 03:44:31
Perl
基因组建模系统（GMS） 描述GMS的论文已发表在这里： 。 要简要演示GMS，请从以下内容开始：。 主页上提供了更详细的文档和教程： 本文档包括：， 的， ，的等。 GMS的安装有多种途径。 以下方法已经过测试，并具有相关的教程和其他文档：在专用硬件上，作为预配置的VirtualBox虚拟机，使用Vagrant在Amazon（AWS）EC2实例上使用OpenStack实例在Docker上创建虚拟机。 有关更多详细信息，请参考。 通过GMS提供的某些工具可以从单独下载。 GMS教程所需的原始数据和参考文件可通过我们的和。 GMS的安装涉及安装许多常用的生物信息学工具，postgres数据库，其他服务以及使用以下git存储库：， UR ， gms-webviews和tgi-workflow 。 由Genome Institute开发的其他相关项目可以在github基因组中找到
【文件预览】：
gms-ubuntu-12.04
----Vagrantfile(33B)
----Vagrantfile.standalone.virtualbox(7KB)
----downsampled-demo-data()
--------example-run-downstream-analysis.sh(5KB)
--------example-import-data.sh(18KB)
--------example-run-initial-analysis.sh(11KB)
----LICENSE(7KB)
----install.sh(929B)
----Vagrantfile.standalone.aws(2KB)
----done-repo()
--------.gitkeep(0B)
----.gitignore(373B)
----done-host(27B)
----Makefile(27KB)
----demo-data()
--------import-hcc1143-data.sh(9KB)
----README.md(4KB)
----setup()
--------bin()
--------manifests()
--------stage()
--------archive-files()
--------metadata()
--------debconf.in(147B)
--------prime-disk-allocations.pl(5KB)
--------install_custom_r()
--------gms-home-skel()
--------aws()
--------dirs(48B)
--------s3fs.cpp.patch(342B)
--------system_tests()
--------packages.lst(881B)
--------prime-system.pl(13KB)
--------fdisk_input.txt(27B)
--------prime-sqlite.pl(218B)
--------home()
--------prime-timeline-allocations.pl(381B)
--------schema.psql(104KB)
--------openlava-config()
--------etc()