文件名称：竞争标签亲和力：研究标记的配体亲和力在竞争实验中的影响
文件大小：47KB
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更新时间：2024-03-08 03:06:53
Python
竞争标签亲和力 在竞争实验中研究标记的配体亲和力的影响。 代码随附Shave等人的论文“基于竞争的主筛选的最佳配体亲和力”。 等 要求 使用python 3.7.1开发的代码，但应与任何3.6或更高版本的Python一起使用。 还需要以下软件包 Matplotlib（2.x） 脾气暴躁（1.15.x） mpmath（1.1.0） 程序定义 01_plot_protein_needed_vs_ligand_kd.py 绘制配体pKD与浓缩蛋白的关系图，以实现所需的（默认值= 0.7）级分配体结合。 01_plot_singal_vs_ligand_kd_fixed_inhibitor.py 绘制配体pKD与部分配体结合 01_simulate_competition_experiment.py 从竞赛实验中模拟一个简单的单点。 02_inhibitorKD_vs_fraction
【文件预览】：
competition-label-affinity-master
----02_ligandKD_vs_fractionBound_animation.py(4KB)
----high_accuracy_binding_equations.py(40KB)
----01_plot_singal_vs_ligand_kd_fixed_inhibitor.py(1KB)
----01_plot_protein_needed_vs_ligand_kd.py(1KB)
----02_inhibitorKD_vs_fractionBound.py(2KB)
----02_inhibitorKD_vs_fractionBound_interactive.py(3KB)
----06_KDPL_vs_FLB_VaryingL0.py(3KB)
----09_KDPL_vs_FLB_VaryingL0AndTFLB.py(4KB)
----01_simulate_competition_experiment.py(1KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(3KB)
----04_missed_inhibitors.py(2KB)
----07_KDPL_vs_FLB_VaryingI0.py(3KB)
----02_ligandKD_vs_fractionBound.py(2KB)
----03_ligandKD_vs_fractionBoundAsPercentSignalReduction.py(3KB)
----10_write_lookup_table.py(2KB)
----.gitignore(2KB)
----02_ligandKD_vs_fractionBound_interactive.py(3KB)
----02_inhibitorKD_vs_fractionBound_animation.py(4KB)
----05_KDPL_vs_FLB_VaryingTargetFLB.py(3KB)
----08_HuangPlot.py(2KB)
----Figure01-0.7.svg(78KB)