快速高斯点扩展函数拟合 (MEX):将高斯 PSF 模型快速拟合到图像中的候选位置列表。-matlab开发

时间:2024-06-18 18:54:51
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文件名称:快速高斯点扩展函数拟合 (MEX):将高斯 PSF 模型快速拟合到图像中的候选位置列表。-matlab开发

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更新时间:2024-06-18 18:54:51

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在图像中显示为二维高斯形状的许多发射器的快速准确定位是荧光显微镜中的重要工具。 这主要用于“定位显微镜”,它能够产生生物样品的超分辨率(分辨率低于衍射极限)图像。 用于此任务的流行工具包括 RapidStorm 和 QuickPalm (ImageJ)。 该软件允许使用 MEX 文件界面快速准确地进行点扩散函数拟合,直接在 MATLAB 程序中使用。 这是为了促进新的和更好的可定制方法的开发,因为基于 Matlab 的拟合通常对于需要处理的数据量来说太慢了。 拟合代码利用谷歌 (2016) 目前开发的 ceres-solver 库进行优化。 在用户提供候选位置列表后,拟合器返回参数 [xpos; ypos; 振幅; 当地背景; 每个候选的标准偏差_x,标准偏差_y,角度[度],错误标志]。 初始猜测可以由用户提供,也可以由算法估算。 可以为优化设置固定的任意参数。 默认情况下,拟合各向同


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FastPsfFitting_26July2016.zip
FastGaussianPsfFitting_09Mar2016.zip

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