文件名称：DiNAMO:区分性DNA IUPAC主题发现工具
文件大小：2.44MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 11:20:52
C++
DiNAMO：在DNA序列中发现IUPAC基序的精确有效方法 DiNAMO软件实现了穷举算法，以检测一组DNA序列中过度代表的IUPAC图案。 它有两种模式：扫描模式（默认）（其中所有窗口均被解析）或固定位置模式（请参阅可选参数-p ），其中仅考虑出现在序列中特定位置的图案。 DiNAMO可用于多种应用中，例如用于转录因子结合位点鉴定的ChIP-seq峰分析，或发现诱导系统测序错误的基序。 安装 二进制文件 Windows，OS X和Linux的二进制文件可。 从源代码构建 依存关系 Boost library (if not in the standard includes, please use -I /path/to/boost in the Makefile) 汇编 make 可执行文件位于bin /目录中 用法 DiNAMO将两个Fasta文件作为输入，分别包含正数据集（s