文件名称：癌症种族差异
文件大小：13.42MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-05 09:52:36
癌症种族差异 在该存储库中，有两个Jupyter Notebook文件，基因列表和基因图，我在我的项目中使用了“通过使用TCGA数据和基于Web的分析工具评估各种癌症中的遗传，转录组和蛋白质组生物标志物来研究癌症中的种族差异” 。 我还添加了从cBioPortal和PanCancer Atlas页面（ ）下载的数据文件。 为了使所有代码正常工作，必须将！cbioportal.ipynb和！reactome.ipynb放置在主文件夹中（此处称为“ projectfiles”）。 必须将一个名为“ genelists”的文件夹嵌套在该文件夹内，并且必须将基因列表文件（！genes.txt）放在genelists中。 使用基因图谱试图简化Reactome对基因标识符的解释，尽管这可能不是必需的。 我只是将UniProt数字标识符粘贴在在！reactome.ipynb中运行export（typ
【文件预览】：
cancer-racial-disparity-main
----projectfiles()
--------!cbioportal.ipynb(15KB)
--------genemap.xlsx(14KB)
--------data()
--------!reactome.ipynb(7KB)
--------genelists()
----README.md(2KB)